Налоговые проверки ИТ бизнеса

Важным этапом осуществления контроля со стороны государства за деятельностью ИТ-компаний стало возобновление с марта 2025 года налоговых выездных проверок[1], мораторий на которые был введен в марте 2022 года, то есть фактически к концу трехлетнего периода с введения налоговых ИТ-льгот.

Это совпадает с тенденцией роста налоговой нагрузки ИТ бизнеса, то есть с моментом, когда риски результативности проводимых налоговых проверок растут.

Например, с 2025 года налоговая ставка для ИТ-компаний выросла с 0% до 5%, что не только сказалось на фактическом росте налоговых платежей, но и повысило внимание со стороны налоговых органов к документальному подтверждению и экономическому обоснованию расходов, которые несут ИТ-компании. А, следовательно, повысило риски роста налоговой базы, к которой применяется 5% ставка, а значит и риски изменения пропорции квалифицированной ИТ-выручки, влияющие на право применения ИТ-льгот.

Общий состав налоговых изменений льготного ИТ-режима по состоянию на февраль 2026 года следующий:

Отдельно стоит отметить, что при внесении Законопроекта №1026190-8[4] в Госдуму, освобождение ИТ-компаний от уплаты от НДС полностью отменялось, а пороговое значение доходов для уплаты НДС было ниже – всего 10 млн рублей. Такой скачок ставки НДС с 0% до 22%[5] вынудил ИТ-ассоциации обратиться в Минфин России с просьбой сохранить льготу по уплате НДС, в результате которой отмена льготы по НДС была отложена[6], а пороговые значения применения НДС компаниями на спецрежимах – повышены.

Совокупное и постепенное уменьшение льгот для ИТ-отрасли уже с 2025 года значительно увеличило общую налоговую нагрузку, а с 2026 года – особенно у малого и среднего бизнеса. А потенциальная возможность уплаты НДС в общем порядке влечет за собой не только увеличение налогового бремени, но и необходимости ведения учета и большей отчетности. Принимая во внимание изменений, применимые к продлению ИТ-аккредитации крупных компаний, налоговая экономия перестает быть налоговой экономией в привычном значении и становится частично возвращаемой государству в виде инвестиций в образование.

По данным Минцифры России[7], по результатам плановой проверки в 2025 году почти 20 000 компаний сохранили ИТ-аккредитацию, которая дает право на применение, среди прочего, налоговых ИТ-преференций. Такое количество аккредитованных свидетельствует о том, что объем налогоплательщиков в отношении которых не проводились выездные налоговые проверки достаточно существенен и не всем из них удастся в итоге обойтись без финансовых потерь.

Уже в марте 2025 года налоговые органы начали активно проверять правомерность применения ИТ-льгот за 2022-2024, а именно в этот период ставки налога на прибыль были минимальными, значит, в случае необоснованного применения таких льгот – доначисления будут максимальные: с 0% до 20% по налогу на прибыль и с 7,6% (15%) до 30% по страховым взносам. Если проверка затронет I и II кварталы 2025 года, то доначисления будут еще более существенными: налог на прибыль придется заплатить по ставке в 25%.

Иными словами, участники рынка только сейчас могут испытать все аспекты требований налоговых органов и глубину их проверок, помимо проверок аккредитаций от Минцифры.

К основным обстоятельствам, на которые налоговый орган обращает повышенное внимание в направляемых налоговых требованиях, в частности, относятся:

• привлечение субподрядчиков для целей квалификации дохода, полученного от оказания услуг и выполнения работ, в качестве «квалифицируемого» ИТ-дохода
• факт сопровождения ПО, не модифицированного и не адаптированного ИТ-компанией
• порядок формирования себестоимости и тарификации ИТ-услуг
• перевыставление расходов компаниям группы, не являющихся заказчиком ИТ-услуг по договору
• отсутствие прав на разработку модулей ПО, их адаптацию или модификацию
• отсутствие самостоятельности принимаемых ИТ-компанией управленческих решений
• отсутствие человеческих ресурсов, необходимых для оказания ИТ-услуг
• отсутствие самостоятельных материальных ресурсов для ведения заявленной коммерческой деятельности

Нашей командой накоплен существенный опыт ведения налоговых споров и прохождения налоговых проверок ИТ бизнеса. При необходимости мы готовы оказать поддержку по следующим направлениям:

1. анализ и подготовка ответов на комплексные требования налоговых органов в ходе проверки
2. доработка имеющейся в компании документации, необходимой для обоснования соответствия критериям применения льготного налогового ИТ-режима
3. сопровождение налогового спора на досудебной и судебной стадиях

_______________________________________________

[1] Письмо ФНС России от 24 марта 2022 года № СД-4-2/3586@ «О назначении ВНП в отношении аккредитованных IT-организаций»

[2] На момент первого чтения законопроекта, вносящего изменения в НК РФ, освобождение от уплаты НДС для ИТ-отрасли отменялось

[3] На момент первого чтения законопроекта, вносящего изменения в НК РФ, такое пороговое значение было равно 10 млн рублей

[4] Сейчас – Федеральный закон от 28 ноября 2025 года № 425-ФЗ «О внесении изменений в части первую и вторую Налогового кодекса Российской Федерации, отдельные законодательные акты Российской Федерации и признании утратившими силу законодательных актов (отдельных положений законодательных актов) Российской Федерации»

[5] С 1 января 2026 года базовая ставка НДС была повышена с 20% до 22% согласно Федеральному закону от 28 ноября 2025 года № 425-ФЗ.

[6] По заявлению вице-премьера, руководителя аппарата правительства Дмитрия Григоренко, правительство полагает возможным отложить отмену действующей льготы по НДС, которая сейчас (прим. в 2026 году) может негативно сказаться на темпах развития и внедрения развития ПО в экономике

[7] Информация от 14 августа 2025 года в официальном аккаунте Минцифры России в телеграм

Авторы

• Андрей Грачев, партнер, глава налоговой практики
• Антон Борисичев, советник
• Арина Шештанова, юрист